Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms