Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms