Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHOX2BQ99453 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2BQ99453 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms