Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL15Q96M94 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL15Q96M94 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms