Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00479Q96M42 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms