Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNBD2Q96M20 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms