Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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KCNS1Q96KK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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KCNS1Q96KK3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS1Q96KK3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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KCNS1Q96KK3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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KCNS1Q96KK3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNS1Q96KK3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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