Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP36Q96EU6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP36Q96EU6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms