Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGF29Q96ES7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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