Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIFAP3Q92845 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms