Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms