Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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