Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP38Q8NB14 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP38Q8NB14 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms