Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms