Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVOPQ8N4V2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVOPQ8N4V2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms