Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLASRPQ8N2M8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLASRPQ8N2M8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLASRPQ8N2M8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLASRPQ8N2M8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLASRPQ8N2M8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms