Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms