Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms