Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRCQ7RTU9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCQ7RTU9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCQ7RTU9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms