Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY3Q7L099 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms