Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KNDC1Q76NI1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNDC1Q76NI1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNDC1Q76NI1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNDC1Q76NI1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNDC1Q76NI1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNDC1Q76NI1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNDC1Q76NI1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNDC1Q76NI1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms