Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO4C1Q6ZQN7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO4C1Q6ZQN7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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