Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms