Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREML4Q6UXN2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms