Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC137Q6PK04 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms