Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM88Q6PEY1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms