Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRNP1Q6NT89 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms