Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms