Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF6Q5VXH4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms