Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms