Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms