Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms