Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms