Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP170Q5SW79 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms