Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms