Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BRMS1LQ5PSV4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRMS1LQ5PSV4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms