Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HABP4Q5JVS0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms