Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms