Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD55Q3KP44 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms