Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms