Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISXQ2M1V0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ISXQ2M1V0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms