Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
QSER1Q2KHR3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
QSER1Q2KHR3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms