Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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