Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1FQ16864 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms