Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRNQ16849 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PTPRNQ16849 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTPRNQ16849 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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PTPRNQ16849 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRNQ16849 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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