Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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