Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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FOXD1Q16676 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD1Q16676 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
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