Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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