Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPTX1Q15818 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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