Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 215.72■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 34.4
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SF3B4Q15427 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 414.46□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 513.42□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 IGF2BP3-214ENST00000492771 564 ntTSL 411.34□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 34.4
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SF3B4Q15427 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 34.4
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SF3B4Q15427 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 34.4
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SF3B4Q15427 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 34.4
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SF3B4Q15427 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 216.14■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-14■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-14■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 HSPD1-209ENST00000452200 888 ntTSL 58.28□□□□□ -1.082e-14■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 HSPD1-206ENST00000430176 754 ntTSL 54.59□□□□□ -1.672e-14■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.047e-9■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 515.24■□□□□ 0.037e-9■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 07e-9■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 HNRNPA1-208ENST00000548688 711 ntTSL 36.63□□□□□ -1.355e-10■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 NAV2-201ENST00000349880 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 34.3
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